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“我的工作是用电脑来挖掘和分析病人的健康信息，这些信息来自华盛顿凯撒医疗机构的医生和护士在一个典型的年份里写的数百万份关于病人的临床记录.”
David.S.Carrell@kp.org
206-287-2705
David Carrell, PhD, 是开发和应用从非结构化临床文本中提取丰富信息的技术的助理世界杯下注网站员吗, such as physician progress notes. 这项工作在单站点和多站点设置中使用最先进的临床自然语言处理(NLP)技术.
这项工作的一个例子是一个NLP系统，用于识别被诊断患有复发性乳腺癌的妇女. 尽管这是一种常见且重要的临床诊断, 使用个人病历中的标准医疗代码无法可靠地追踪复发性乳腺癌. 由国家癌症世界杯下注网站所资助, 他和他的同事使用了来自临床医生进展记录的信息, radiology reports, 病理报告根据乳腺癌复发对女性进行分类.
与凯泽永久华盛顿健康世界杯下注网站所内外的世界杯下注网站团队合作, Dr. Carrell已经应用了类似的精确表型方法来识别颈动脉狭窄的证据, colon polyps, problem use of prescription opioids, and colonoscopy quality.
Dr. Carrell目前的世界杯下注网站项目是应用NLP和机器学习方法来改善药物安全监测(通过食品和药物管理局哨兵倡议)，并评估对华盛顿凯撒医疗机构筛查不健康大麻和其他药物使用的患者的药物使用障碍诊断和治疗的影响. 他正在进行的工作还包括开发和应用基于电子健康记录数据的自动算法，以识别具有特定健康状况(称为“患者表型”)的患者，用于遗传和流行病学世界杯下注网站.
与药物暴露相关的不良事件的监测方法, 包括处方阿片类药物的滥用
使用结构化和非结构化电子健康记录数据识别具有(或不具有)特定临床状况或表型的患者的方法，用于大规模流行病学和基因组世界杯下注网站
Identifying recurrent breast cancer using EHR text; Colonoscopy quality metrics
Recurrent breast cancer; Colonoscopy quality; Extracting information from clinical text; Automated de-identification of clinical text; Methods for applying NLP methods in multi-site research
Prevention and treatment
Ferar K, Hall TO, Crawford DC, Rowley R, Satterfield BA, Li R, Gragert L, Karlson EW, de Andrade M, Kullo IJ, McCarty CA, Kho A, Hayes MG, Ritchie MD, Crane PK, Mirel DB, Carlson C, Connolly JJ, Hakonarson H, Crenshaw AT, Carrell D, Luo Y, Dikilitas O, Denny JC, Jarvik GP, Crosslin DR. 人类白细胞抗原区域的遗传变异赋予了艰难梭菌感染的易感性. Sci Rep. 2023;13(1):18532. doi: 10.1038/s41598-023-45649-4. PubMed
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Joo YY, Pacheco JA, Thompson WK, Rasmussen-Torvik LJ, Rasmussen LV, Lin FTJ, Andrade M, Borthwick KM, Bottinger E, Cagan A, Carrell DS, Denny JC, Ellis SB, Gottesman O, Linneman JG, Pathak J, Peissig PL, Shang N, Tromp G, Veerappan A, Smith ME, Chish+++. 电子健康记录中憩室疾病的多祖先基因组和全表型关联世界杯下注网站与自然语言处理富集表型算法. PLoS One. 2023 May 17;18(5):e0283553. doi: 10.1371/journal.pone.0283553. eCollection 2023. PubMed
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